Замечания: 1) Подозрительно податливая Вера. Она пришла на квартиру к Селёдкину как на свидание. Она зашла добровольно или её [инопланетяне] принудили? Если добровольно, то она должна была объяснить причину, почему зашла. Например, ошиблась квартирой или увидела в окне свет среди ночи и т.п. Если ею руководили инопланетяне и она находилась под гипнозом, то не должна была расспрашивать про жизнь Селёдкина. Если же это была девушкой с заниженной социальной ответственностью, то, во-первых, потребовала бы денег, а во-вторых, инопланетяне могли бы и каждый раз новую приводить. Короче, здесь Вера - это картонный эпизодический персонаж, который нужен лишь для того, чтобы показать как в начале хорошо жилось ГГ. На мой взгляд, стоило либо развить её до настоящего персонажа (например, что она вместе с ГГ путешествовала во времени), либо показать сразу много девушек, чтобы читатель не обращал на них внимания.
2) Дружба крепкая, не сломается. Когда ГГ живёт в пещере, окружённой пустыней, к нему приходит его друг из другой эпохи, который ГГ когда-то убил. Неужели ГГ не понимает, что это снова не его друг, а кто-то в его обличии? Такой гений, как ГГ, не может этого не понимать. Тогда почему он расспрашивает "друга" про какую-то Лену? Почему не бросился бежать прочь от "друга", ведь тот явно хочет его вновь убить? Кончено, ГГ смерти не боялся, но всё равно ничего хорошего от незнакомца ждать не следовало.
3) Реинкарнация. Я ожидал, что в конце ГГ превратится в медузу (ведь именно про медуз смотрел фильм ГГ в начале). Не скажу, что в селёдку хуже, но это оказалось для меня неожиданно.
4) Не всё хорошо, что хорошо кончается. Мне кажется, зря вы сделали хороший конец истории. Точнее, он даже не хороший, а просто всё вернулось на круги своя. А хотелось бы, чтобы ГГ извлёк из всего какой-нибудь урок. Пусть даже осознание к нему бы
пришло слишком поздно.
5) Сократить. Я бы выкинул самое начало рассказа, описывающее увольнение ГГ с работы. На сюжет это не влияет. Можно было сразу начинать с прихода друга.
6) В чём же состояли задачи? Жаль, что формулировки задач, которые решал ГГ, я так и не увидел. Мне интересно, как давались начальные данные. Ему присылали целые энциклопедии об истории тех или иных цивилизаций? Перечисляли координаты планет и кораблей? Уж слишком много данных потребуется. Я думаю, надо было поступить так. Инопланетяне не давали ГГ никаких прямых сведений. Они ставили задачу на языке математики в терминах теории множеств, категорий и т.п. То есть они давали уже построенную модель. И эту модель ГГ уже понимал и мог с ней работать. И выдавал данные чисто математические. А как они соотносятся с цивилизациями, сам бы он не понимал.
А самое интересное, как инопланетяне проверяли, что решение верное? Вот встретились в космосе два флота. Вот-вот начнётся война, которая может окончиться уничтожением цивилизации. Инопланетяне такие: "А давай дадим рассчитать исход случайному человеку с маленькой голубой планеты в том закутке Вселенной. Вдруг он решит задачу? Ой, не решил. Цивилизация погибла. Ничего, попробуем другого человека. Вдруг у того получится..." Думаю, с проблемой P = NP вы знакомы. Тогда знаете, что не все решения можно проверить.
7) Про инопланетян мы ничего не знаем. Поэтому тот факт, что в конце одни хозяева сменились другими, не радует и не огорчает. Новые хозяева добрее или злее? Нет. Да и ГГ это не особо волнует. Так что смысл этого события в контексте рассказа не понятен. И как гений-ГГ не смог понять, что рассчитывает не судьбу цивилизаций, а какие-то коммерческие махинации инопланетян? Вот если бы ГГ получал уже готовую математическую модель, смысл который оставался бы ему непонятным (как я описал выше), то это оправдало бы "слепоту" ГГ.
8) Самое главное замечание. Почему ГГ не использовал свой талант в своих личных целях? Почему он не смог просчитать своих хозяев? Почему не смог распознать друга? Просто получается, что весь рассказ делится на две истории: это ГГ и его жизнь, и судьбы цивилизаций во Вселенной. И эти две истории не пересекаются. Я бы посоветовал вам посмотреть фильм
"Час расплаты" (2003). Там тоже ГГ гений, который борется против тайной организации, которая его наняла. И там он свой талант в своей жизни явно применяет.